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小麦叶锈菌与TcLr19非亲和互作cDNA文库的EST分析

标题: 小麦叶锈菌与TcLr19非亲和互作cDNA文库的EST分析
英文标题: Analysis of Expression Sequence Tags During Incompatible Interaction Between Leaf Rust (Puccinia triticina) and TcLr19 Using a cDNA Library
作者: 陈玉婷,陈云芳,李淑凤,杨文香,刘大群
出版时间: 2010-01-01
机构: 河北农业大学
关键词: 小麦,叶锈菌,cDNA文库,表达序列标签
英文关键词: wheat,Puccinia triticina,cDNA library,expressed sequence tag (EST)
刊名: 中国农业科学
英文刊名: Scientia Agricultura Sinica
ISSN: 0578-1752
卷号: 024
基金: ^A河北省自然科学基金^BC2006000438^D1
页码: 5037-5045
分类号: S435.121
摘要: [目的]建立小麦叶锈菌与小麦非亲和互作的基因表达数据库,为从分子水平阐明小麦抗叶锈病机制奠定基础.[方法]对叶锈菌诱导的TcLr19小麦叶片cDNA文库随机测序,利用BLASTx对所得序列进行功能注释,按照Bevan的植物基因功能分类标准进行分类.采用RT-PCR技术,以Actin为参照,对2条信号转导相关基因和3条抗病与防御相关基因进行表达分析.[结果]随机对cDNA文库中756个阳性克隆测序,获得649条高质量EST.对EST序列聚类拼接获得472条非重复序列(Unisequence).功能分类结果表明,25.2%为未知功能蛋白,21.0%与能量代谢基因相关,17.8%与抗病防御基因及信号转导基因相关,其余EST分别与转录、转运、蛋白代谢等功能基因相关.RT-PCR分析结果表明同一基因在叶锈菌侵染后不同时间点的小麦叶片中表达量不一致,且各基因有不同的表达模式.[结论]推测钙转运ATP酶,谷胱甘肽-S-转移酶,蛋白激酶Ptil,NBS-LRR抗病蛋白和分子伴侣DnaJ等参与了小麦与叶锈菌的非亲和互作过程.该cDNA文库可用于了解小麦与叶锈菌非亲和互作过程中的功能基因,为建立研究病原菌基因及小麦抗病基因数据库奠定基础.
英文摘要: [Objective] The objective of this study is to develop an EST database of wheat infected by avirulent Puccinia triticina isolate and provide a base for understanding the wheat resistant mechanism to the pathogen at the molecular level.[Method]The positive clones of TcLr19 cDNA library from wheat leaves induced by P.triticina were picked up randomly for sequencing,and the qualified expressed sequence tags (ESTs) were annotated.The functional classification of all ESTs was established based on the database ent...